統計ER

統計ソフトRの使い方を中心に、統計解析方法の解説をするブログ。ありそうでなかなか見つからないサンプルサイズ計算などニッチな方法について紹介しています。

グラフ

EZRで比例ハザード性を確認するには?

生存時間解析でCox回帰を行う前提として比例ハザード性が確認できていないといけない。 比例ハザード性はどのように確認すればいいのか?

EZRで描いたカプランマイヤー曲線の横軸を変更したい

EZRでカプランマイヤー曲線は描けたのだが、横軸(時間軸、X軸)を調整したい。 どうやれば、変更できるか?

EZRで描いたグラフを修正する方法 ― Macでは?Windowsでは?

EZRでグラフを描いたあと、一部文字を消したり、文字を加えたり、図形を加えたり、ちょっとした修正を行いたいことがある。 そういうときに、Mac版であれば、どうしたらよいか? Windows版であれば、どうすればよいか?

EZRでグループ別の散布図を描く方法

EZRでグループ別の散布図はどのようにして描くのか? 色はどのようにして変更するのか? 点の形は変更できるのか?

EZRでグラフの凡例の位置を調整するには?

統計ソフトEZRは、無料で使えて、しかもメニューから選択するタイプの使いやすい統計ソフトだ。 グラフを描く機能も優れている。 たまに、グラフの凡例がグラフと重なることがある。 それを調整するにはどうしたらよいか?

EZRのグラフの色を変えるには?

統計ソフトEZRは無料で使えるのに、メニューから統計解析を選んで操作できる、初心者に優しいソフトウェアだ。 ただし、グラフの色を変えるには少しコツがいる。 少しだけRスクリプトを知る必要がある。 この記事を読めば、どこをどのように変えれば、色を変…

生存期間中央値の求め方 - 5年生存率から逆算で求める方法

がん患者さんの生存期間中央値を5年生存率から逆算で求めるにはどうしたらよいか?統計ソフトRで実施してみた。

統計ソフトRを使ったグループごとのカプランマイヤー曲線の描き方

生存時間データ図示の代表格、カプランマイヤー Kaplan-Meier 曲線はどうやって描くか?統計ソフトRでやってみた。

統計ソフトRで描いたグラフの一部を塗りつぶすには?

グラフを描いた後、一部を塗りつぶしたいときがある。 そんなときにどうしたらいいか?

統計ソフトRでヒストグラムを描くには?

ヒストグラムは、データの広がりやどんなデータが多くて、どんなデータが少ないかを表すグラフ。

統計ソフトRでいくつかのグラフを並べて描く方法は?

一つの画面に複数のグラフを並べて描きたいときがある。そんなときはどうするか?

カプランマイヤー曲線を描くためには?

イベント発生と発生までの時間データを解析する場合、 グラフで概観する方法がカプラン・マイヤー(Kaplan-Meier)曲線だ。

統計ソフトRでグラフを調整する方法

統計ソフトRはグラフ描画機能に優れている。 でも、ここをちょっといじりたいんだけど・・・ というところがいくつも出てくる。 そんなときにどうするか。まとめてみた。

統計ソフトRで棒グラフを描くには?

統計ソフトRで棒グラフはbarplot()を使って描ける。

出版バイアスの検出―相関や回帰で検討するには?

出版バイアスを検討するには、 ファンネルプロットを描く以外にも、 順位相関や回帰分析を使う方法がある。 順位相関や回帰分析を使った方法3つを統計ソフトRで行う方法を紹介。

出版バイアスをチェック!―ファンネルプロットはどう描く?

メタアナリシスを実施する際には、 統合しようと決めた研究結果に、 出版バイアスがないかどうかを確認することが重要だ。 出版バイアスとは、論文公表に当たっての偏りのことだ。 論文が学術雑誌の編集部に受理されて、 公表されるのには傾向がある。

メタアナリシスのグラフ―フォレストプロットはどう描く?

メタアナリシスをまとめるときに、 必ず登場するのがフォレストプロット(forest plot)。 個々の研究の結果と、 統合した結果を一度に描いたグラフ。 フォレストプロットが簡単にきれいに描けるのが、 統計ソフトRのmetaforパッケージだ。

二項分布ってどんな分布?どんな時に使う?

二項分布とはどんな分布か?どんな時に使うか?

正規分布の描き方―統計ソフトRの場合

正規分布(ガウス分布)は釣り鐘型をした分布で、 統計学に出てくる確率分布の基本。 データの散らばりが、 正規分布している前提で、 話を進めていることがほとんど。 理論的な正規分布を統計ソフトRでどのように書くかという話。

ポアソン分布ってどんな分布?

ポアソン分布は、 数学者ポアソンが発表した、 離散確率分布。 離散とは、 離れているということ。 0回、1回、2回、3回・・・ ポアソン分布を統計ソフトRで図示してみた。

統計ソフトRでAPCモデル分析をするには?

年齢・時代・コホート(age-period-cohort、APC)モデルは、 病気の原因を年齢と時代とコホートとに分けて分析する方法だ。 コホートは、同世代とか同級生みたいな意味。 年齢と時代とコホートは、 ほとんど同じようなものなのに、 同時に分析できるのか?

統計ソフトRで薬剤経済学の分析をするには?

薬剤経済学は、薬剤の持つ効力を、経済で測って吟味する学問。 新薬につけた薬価が、本当にその薬価に見合った効果を発揮しているかを吟味し、政策に生かそうとする学問。

統計ソフトRでROC曲線分析はどうやるか?

ROC曲線分析は、病気の診断のための検査を分析するために使われる。 真実の分類と、真実の分類を見分ける検査結果を使って、どのレベルより上だと病気とするか?を決める分析だ。