統計ER

統計ソフトRの使い方を中心に、統計解析方法の解説をするブログ。ありそうでなかなか見つからないサンプルサイズ計算などニッチな方法について紹介しています。

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EZRで比例ハザード性を確認するには?

生存時間解析でCox回帰を行う前提として比例ハザード性が確認できていないといけない。 比例ハザード性はどのように確認すればいいのか?

EZRで連続量を正規分布にする方法 Box-Cox 変換

連続量を何らかの方法で正規分布に近づける方法はいくつかある。 よく使う方法は自然対数をとる方法だ。 ここではBox-Cox変換の方法をまとめてみた。

EZRで描いたカプランマイヤー曲線の横軸を変更したい

EZRでカプランマイヤー曲線は描けたのだが、横軸(時間軸、X軸)を調整したい。 どうやれば、変更できるか?

EZRで描いたグラフを修正する方法 ― Macでは?Windowsでは?

EZRでグラフを描いたあと、一部文字を消したり、文字を加えたり、図形を加えたり、ちょっとした修正を行いたいことがある。 そういうときに、Mac版であれば、どうしたらよいか? Windows版であれば、どうすればよいか?

EZRでグループ別の散布図を描く方法

EZRでグループ別の散布図はどのようにして描くのか? 色はどのようにして変更するのか? 点の形は変更できるのか?

EZRでフィッシャーの正確検定が有意なのに95%信頼区間が1をまたいでいる場合どうしたらよいか?

オッズ比の95%信頼区間が1をまたいでいないことと、有意水準5%で統計学的有意であることがイコールであることは知っていると思う。 しかし、EZRでフィッシャーの正確検定を実施すると、有意確率が5%未満であるにもかかわらず、オッズ比の95%信頼区間が…

EZRのFisherの正確検定でオッズ比を計算するとオッズ比が違う件

EZRのFisherの正確検定の関数でオッズ比を計算すると、通常のオッズ比と異なる数値が計算される。 これはなぜなのか? どう考えたらよいか? EZRのFisherの正確検定を使わないオッズ比の計算 EZRのFisherの正確検定を使った場合のオッズ比の計算 EZRのFisher…

EZRのフィッシャー正確検定でオッズ比の信頼区間のパーセントを変えるには?

統計ソフトEZRは、無料で使えて、しかもメニューから選んで分析できる、簡単便利な統計ソフト。 フィッシャーの正確検定でオッズ比の信頼区間のパーセントを変えることはできるか?

EZRでグラフの凡例の位置を調整するには?

統計ソフトEZRは、無料で使えて、しかもメニューから選択するタイプの使いやすい統計ソフトだ。 グラフを描く機能も優れている。 たまに、グラフの凡例がグラフと重なることがある。 それを調整するにはどうしたらよいか?

EZRの起動時のフォントやフォントサイズを変更するには?

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統計ソフトEZRは無料で使える、医療統計に最適なソフトウェア。 起動時のフォントやフォントサイズを変更するにはどうやったらいいか。

EZRのグラフの色を変えるには?

統計ソフトEZRは無料で使えるのに、メニューから統計解析を選んで操作できる、初心者に優しいソフトウェアだ。 ただし、グラフの色を変えるには少しコツがいる。 少しだけRスクリプトを知る必要がある。 この記事を読めば、どこをどのように変えれば、色を変…

反復測定分散分析 群分けあり Split Plot Design 二要因混合計画 はどう解析する?

ある要因Aありなしで、何例かずつ、何回かにわたって測定したときの解析はどうやったらいいか。 繰り返し測定されているデータがあり、経時的なデータの変動パターンに興味があってそれを解析するならば、Split Plot Designと考えて解析する方法がある。二要…

統計ソフトRで一元配置分散分析一歩一歩

統計ソフトRで、一元配置分散分析を one by one でじっくり計算してみた。 lm() と Anova() を使えばあっという間だが、具体的な一つ一つの計算を自分で組み立ててみるとどうか? 教科書の例題に沿って確認した。

平均値の多重比較でBonferroni型p値調整をするには?

三群以上の平均値を比較するときに、 単純に二群比較を繰り返してはいけないことはご存知と思う。 有意水準の調整によって簡単に処理する方法が Bonferroni ボンフェローニ の方法とその進化版だ。 統計ソフトRでBonferroni型のP値調整で多重比較を行ってみ…

チューキー検定はどうやる?

チューキー検定 テューキー検定 Tukey testを行うにはどうしたらいいか? チューキー検定は、三群以上のグループを総当たりで比較する方法。 二群の比較を繰り返すのは不適切なので、チューキー検定が必要になる。

ダネット検定をするには?

ダネット検定 Dunnett testをするにはどうしたらよいか? ダネット検定は、比較対照群といくつかの実験群を多重比較する方法。 比較対照群との比較を繰り返すのは不適切なので、ダネット検定が必要になる。 統計ソフトRでダネット検定をやってみた。

Cox比例ハザードモデルを用いた非劣性試験のサンプルサイズ計算はどうやる?

Cox比例ハザードモデルを用いた非劣性試験のサンプルサイズ計算はどうやるか? 統計ソフトRでスクリプトを書いてみた。

平均値の非劣性検定のサンプルサイズ計算はどうやる?

非劣性試験のエンドポイントが連続量で、 各群の平均値を求める場合、 サンプルサイズはどのように計算するか? 統計ソフトRのスクリプトにしてみた。

割合の非劣性検定のサンプルサイズ計算はどうやる?

非劣性検定は劣っていないことを証明する検定。 割合の非劣性検定のサンプルサイズ計算はどうやるか?

Cox比例ハザードモデルのサンプルサイズ計算はどうやる?

コックス Cox の比例ハザードモデルで解析する場合のサンプルサイズ計算の方法。 いくつか方法があるのでご紹介。

カプランマイヤー曲線を描くためには?

イベント発生と発生までの時間データを解析する場合、 グラフで概観する方法がカプラン・マイヤー(Kaplan-Meier)曲線だ。