統計ER

R, EZR, SPSS, KH Coder を使ったデータ分析方法を紹介するブログ。ニッチな内容が多め

EZR

回帰直線の書き方 信頼区間のつけ方 EZR の場合

EZRで回帰直線のグラフに95%信頼区間を付ける方法

同等性検定のサンプルサイズ計算

積極的に同等であることを証明していく同等性の検定。 サンプルサイズ計算はどのようにすればよいか?

指数関数データの回帰分析

指数関数的に上昇するデータを共変量調整の回帰分析したい場合どのようにすればよいか? ガンマ分布の一般化線形モデルを使えばできる。

メタアナリシスの重み付けの話

複数の研究を統合するメタアナリシス。 固定効果モデルと変量効果モデルが存在する。 統合する際の重みが異なるのが一番の違い。 どんな重み計算をしているのか?

逆確率重み付け IPTW とは?逆確率重み付け回帰

逆確率重み付けとは、傾向スコアの逆数を用いて、人数があまり多くない層を厚くする方法で、処方の有無の背景をそろえる方法である。 重回帰で用いる方法。

傾向スコアマッチングのキャリパーについて

傾向スコアマッチングのキャリパーはどのくらいが正解か? ネット上にある情報をまとめてみた。

EZR の ROC曲線グラフ X軸を 1 - 特異度 にする方法

EZR の ROC 曲線グラフのX軸を 1 - 特異度にする方法。

ログランク検定をわかりやすく解説

生存時間解析に登場する群間比較検定のログランク検定。 いったいどんな計算をしているのか? わかりやすく解説。

線形混合モデルの解析方法 反復測定分散分析との比較

EZR で線形混合モデルの解析方法 反復測定分散分析との違い

ブートストラップ ロジスティック回帰分析

ブートストラップとは、小さいサンプルを復元抽出で何度もサンプリングして、疑似的に何度も試行したことにして、その結果から推定値の直接的な95%の範囲を求めたりする方法。 ブートストラップを使ったロジスティック回帰分析の方法をご紹介。

EZR で共分散分析 ― 回帰直線の差の検定

共分散分析を使えば、2つの回帰直線の傾きや切片が異なるかどうか検討できる。 直接的な傾きの差の検定や切片の差の検定ではないが、同様な結果が簡単に得られるので、共分散分析でよいと思っている。

反復測定分散分析を EZR と SPSS で行う方法

反復測定分散分析を SPSS で行う方法 EZR の方法と結果を踏まえて解説

EZR でロジスティック回帰の多変量 ROC 曲線を比較するには?

ロジスティック回帰の回帰診断の一つにROC曲線を活用する方法がある。 ロジスティック回帰モデルを多変量で行えば多変量ROC曲線となる。 モデルごとに算出されるROC曲線を比較するにはどのようにすればよいか?

オッズ比のサンプルサイズ計算

オッズ比のサンプルサイズ計算の方法

EZR のエクセルへの出力方法

EZRの出力は固定長といってスペースできれいに整えられている。 Excelのテキストファイルウィザードを使用すればきれいに貼り付けることができる。

EZR の 2群の比率の差の信頼区間 小数点以下の桁を増やす方法

EZRで2群の比率の差の信頼区間を求めると小数点以下3桁に丸められた数値が出力される。 小数点以下の桁数を増やす方法。

EZRで出力結果をエクセルに貼り付けたりファイルに出力したりする方法

EZRの出力をきれいにエクセルに貼り付ける方法があるか? エクセルで開けるファイルに出力する方法があるか? EZRの出力結果をきれいにエクセルに貼り付ける方法 EZRの出力結果をエクセルで開けるファイルに出力する方法 まとめ おすすめ書籍 >>もう統計で…

比例ハザード性を確認する方法 二重対数プロットと検定

Cox 回帰で必要な、比例ハザード性を確認する方法の解説

EZR のカプランマイヤー曲線グラフの編集方法 横軸編

EZRでカプランマイヤー曲線を書いた後に、横軸を調整する方法

EZR のグラフを編集する方法

EZRでグラフを描いたあと、一部文字を消したり、文字を加えたり、図形を加えたり、ちょっとした修正を行う方法

EZRで散布図を書く方法 色分けと点の形の変更方法

EZRで散布図を書く方法を解説。 色分けや点の形を変えて、グループ別に描画する方法を解説する。

95 パーセント信頼区間が 1 をまたいでいるが統計学的有意である場合

オッズ比の95%信頼区間が1をまたいでいないことと、有意水準5%で統計学的有意であることはイコールである。 しかし、EZRでフィッシャーの正確検定を実施すると、有意確率が5%未満であるにもかかわらず、オッズ比の95%信頼区間が1をまたいでいることが…

EZR のオッズ比計算の注意点

EZRのFisherの正確検定の関数でオッズ比を計算すると、通常の手計算で計算できるオッズ比と異なる数値が計算される。 これはなぜなのか?

EZRのフィッシャー正確検定でオッズ比の信頼区間のパーセントを変える方法

EZR のフィッシャーの正確検定でオッズ比の信頼区間のパーセントを変える方法。

EZR のグラフを調整する方法 凡例編

EZR のグラフの凡例を調整する方法

EZRのフォントの変更方法

EZR のフォントやフォントサイズを変更するにはどうやったらいいか。

EZR でヒストグラムを書く方法 色を変える

EZR でヒストグラムを書いて、色を変える方法

相関係数の計算、検定、サンプル数計算の方法

相関係数の計算に必要なサンプル数 データ数はいくつか? 相関係数の検定との関係から紹介。 >>もう統計で悩むのを終わりにしませんか? ↑1万人以上の医療従事者が購読中

分割プロット分散分析 反復測定分散分析を R で行う方法

分割プロット分散分析 split-plot design 、群分けのある反復測定分散分析を R で行う方法。

R で一元配置分散分析

Rで、一元配置分散分析を step by step で計算してみた。 lm() と Anova() を使えばあっという間だが、具体的な一つ一つの計算を自分で組み立ててみるとどうか? 教科書の例題に沿って確認した。