Rは、最初からかなりいろいろなことができる無料統計ソフト。
もっとすごいのは、あとからパッケージをインストールして、さらにいろいろな解析ができるようになること。
R は追加パッケージをインストールする前からすごい！
まず、新しいパッケージをインストールしなくてもできる統計解析を挙げてみる。
- 平均
- 標準偏差
- 割合
- 相関係数
- 平均値の差の検定（ｔ検定）
- 割合の差の検定（χ[カイ]2乗検定)
- サンプルサイズ計算
- マクネマー検定
- コクラン・アーミテージ検定
- フィッシャーの正確検定（Fisher Exact Test）
- テューキー チューキーの多重比較検定
- ダネットの多重比較検定
- マン・ホイットニーのU検定
- ウィルコクソンの符号付順位和検定
- クラスカル・ウォリス検定
- 回帰分析
- 重回帰分析
- 分散分析
- 共分散分析
- ロジスティック回帰分析
- ログリニア回帰分析
- 主成分分析
- 因子分析
- k平均法
- 階層クラスタリング
などなどなど。。。
ほかには、パッケージを呼び出す必要があるけど、 改めてインストールする必要がないパッケージがある。 使うときにlibrary()を実行して呼び出す。 ：の右側がパッケージの名前。
- カプラン・マイヤー曲線：survival
- コックスの比例ハザードモデル：survival
- 判別分析：MASS
- 負の二項分布回帰分析：MASS
R はパッケージをインストールするとさらにすごい！
次に、インストールが必要なパッケージ。
- マン・ホイットニーの正確検定ができるパッケージ：coin
- ノンパラメトリック検定のサンプルサイズ計算ができるパッケージ：samplesize
- クロンバックのアルファが計算できるパッケージ：psych
- 多重比較がもっと詳しくできるパッケージ：multcomp
- 疫学のツールパッケージ：epitools
- APCモデルとROCのパッケージ：Epi
- ROCのサンプルサイズ計算パッケージ：pROC
- メタアナリシスが簡単にできるパッケージ：metafor
- コレスポンデンス分析のパッケージ：ca
- k近傍法ができるパッケージ：class
- RidgeとLASSOができるパッケージ：glmnet
- PCRとPLSができるパッケージ：pls
- 決定木分析ができるパッケージ：rpart
- わかりやすい決定木を出力できるパッケージ：partykit
- バギングができるパッケージ：adabag
- ランダムフォレストができるパッケージ：randomForest
- サポートベクターマシーンができるパッケージ(尖度・歪度も計算できる)：e1071
これらは、コンソールで install.packages("パッケージ名")と書いてエンターキーをたたくと、インストールできる。
まず、どこからダウンロードするかの画面が出て、Japanを探して選び、OKをクリックするとダウンロードが始まる。
R にパッケージをインストールする動画
実際のダウンロードの様子は動画参照。
まとめ
R は、最初からすごいソフトウェアだが、パッケージをインストールすることで、さらにいろいろな統計解析ができるようになる、本当にすごいソフトウェアだ。
