統計ER

R, EZR, SPSS, KH Coder を使ったデータ分析方法を紹介するブログ。ニッチな内容が多め

データ・ファイルあり

EZRのグラフの色を変えるには?

統計ソフトEZRは無料で使えるのに、メニューから統計解析を選んで操作できる、初心者に優しいソフトウェアだ。 ただし、グラフの色を変えるには少しコツがいる。 少しだけRスクリプトを知る必要がある。 この記事を読めば、どこをどのように変えれば、色を変…

割合の差の検定のサンプルサイズ計算

二群の割合を比較したいときは割合の差の検定を使う。割合の差の検定を使う場合のサンプルサイズ計算はどのようにすればいいか? 統計ソフトRでやってみるとどうなるか? エクセルではできないか?

Clopper-Pearson法で割合の信頼区間を計算するには?

割合の信頼区間の推定法としてClopper-Pearson法というものを目にしたので、簡易的な割合の信頼区間推定法とどう違うのか統計ソフトRで計算してみた。

Bonferroni 型 多重比較のサンプルサイズ計算 - 統計ソフトRのスクリプト

三群以上の平均値や割合の差を比較したいデザインの場合、サンプルサイズはどのようにすればよいか? Bonferroni (ボンフェローニ)型の比較は、保守的過ぎて有意水準が厳しすぎるとは言われるが、逆にBonferroniの条件を満たすサンプルサイズなら、HolmやH…

生存期間中央値の求め方 - 5年生存率から逆算で求める方法

がん患者さんの生存期間中央値を5年生存率から逆算で求めるにはどうしたらよいか?統計ソフトRで実施してみた。

サンプルサイズ計算のサンプルサイズブック

統計ソフトRによるサンプルサイズ計算スクリプトを集めたサンプルサイズブック。 どんなサンプルサイズ計算がまとまっているか?

点推定値が100%に近いときの信頼区間は?Wilson's score method

点推定値が100%に近いとき、より適切に割合の信頼区間を計算する方法がある。それがWilson's score method(ウィルソンのスコア法)だ。

標本の大きさの求め方 エクセルを使う方法 サンプルサイズ計算をエクセルで

標本の大きさの求め方。エクセルを使う方法。 サンプルサイズ計算をエクセルで行う方法。 なかなか探しても見つからないサンプルサイズ計算がここでは見つかる!!

ログランク検定のサンプルサイズ計算はどうやる?

ログランク検定 log-rank testは、 時間経過とともにイベントが起きていくデータを検定する方法。 患者さんの死亡をイベントとしたデータ、 病気が再発することをイベントとしたデータ、 病気が発症することをイベントとしたデータ、 などが扱える。 病気ば…

級内相関係数(ICC)Case1のサンプルサイズ計算はどうやる?(修正2021年4月17日)

級内相関係数(ICC)は、信頼性指標に使える。 ICC Case1は、一人の検査をする人(検者、けんじゃ)の一貫性を確認する指標だ。 ICC Case1の計算方法と、サンプルサイズ計算方法を、統計ソフトRでご紹介。

トレンド検定のサンプルサイズ計算はどうやる?

トレンド検定のサンプルサイズ計算。 トレンドが見られればOKという試験ならこちら。 トレンドとはカテゴリが大きくなると、 平均値や割合が大きくなるとか小さくなるとか、 傾向や相関があることを指す。 統計ソフトRでやってみた。

ダネット検定のサンプルサイズ計算はどうやる?

ダネット Dunnett 検定のサンプルサイズ計算はどうやるか? コントロール群、統制群、非処理群などと呼ばれる比較対照グループと、複数用量の治療群、処理群を比較するダネット検定のサンプルサイズ計算。 統計ソフトRでやってみた。

クロスオーバー試験のサンプルサイズ計算はどうやる?

クロスオーバー試験とは、二群どちらにも二つの介入を受けてもらう試験。 従来の薬と新薬とか、方法Aと方法Bとか、二つの方法を順番を変えて受けてもらう。 利点は、小さいサンプルサイズで、信頼性の高いデータが取れること。 ただし、一個目の影響がなくな…

Cox比例ハザードモデルを用いた非劣性試験のサンプルサイズ計算はどうやる?

Cox比例ハザードモデルを用いた非劣性試験のサンプルサイズ計算はどうやるか? 統計ソフトRでスクリプトを書いてみた。

非劣性試験のサンプルサイズ 平均値の非劣性検定の場合 EZRの計算方法も

非劣性試験のエンドポイントが連続量で、各群の平均値を求める場合、サンプルサイズはどのように計算するか? RとEZRで行う方法。

非劣性試験のサンプルサイズ 割合の非劣性検定の場合 EZRの計算方法も

非劣性検定は劣っていないことを証明する検定。 割合の非劣性検定のサンプルサイズ計算はどうやるか?

Cox比例ハザードモデルのサンプルサイズ計算はどうやる?

コックス Cox の比例ハザードモデルで解析する場合のサンプルサイズ計算の方法。 いくつか方法があるのでご紹介。

マッチドケースコントロール研究 Matched case-control study のサンプルサイズ計算はどうやる?

重要な因子をケースとコントロールで合わせることをマッチングという。 マッチドケースコントロール研究のサンプルサイズ計算を統計ソフトRでやってみた。

ケースコントロール研究 Case-control study のサンプルサイズ計算はどうやるか?

ケースコントロール研究のオッズ比を求めるためのサンプルサイズ計算はどうやるのか?

分散分析のサンプルサイズ、サンプル数、n数の計算

分散分析のサンプルサイズ、サンプル数、n 数の計算を R でやってみた。

相関係数を求めたいサンプル数が少ないのだが大丈夫か? 目安となるサンプル数

相関係数を求めたいサンプル数が少ないけど、大丈夫なのか? 相関係数が大きい場合、サンプル数は少なくても大丈夫。 目安となるサンプル数はどのくらいか?

アンケートは何人に取ればいい? エクセルでサンプルサイズ計算!

アンケート調査は何人にとったらいいか? 何度も聞かれる質問だ。 そんなざっくりした質問じゃ計算できないのだが、 そういう固いことは言わないのが統計ER。 何とかして手当てするのが統計ER。

比率・割合のサンプルサイズ計算はどうやる?

比率つまり割合が知りたい数値の場合、 サンプルサイズ計算はどうやるか? 方法は二つある。

対応のあるt検定のサンプルサイズ サンプル数の目安

対応のあるt検定は、前後比較をするデザインの時に用いる。 対応のあるt検定のサンプルサイズ、サンプル数はどのくらいであればよいか?

t検定のサンプルサイズ計算はどうやる?

t検定(平均値の差の検定)のサンプルサイズ計算はどうやるのだろうか。 1:1の割り付けじゃなくて、1:2とか1:3とかにするにはどうしたらいいか? 統計ソフトRでt検定のサンプルサイズを計算してみた。

非劣性マージンの決め方 非劣性検定の方法

いままでの方法と比べて、格段にいいとか、際立っていいとか、じゃなくてもいい場合がある。 ダメじゃなければいい。 劣っていなければいい。 劣っていなければいいという検定方法が、非劣性(ひれっせい)検定だ。 じゃ、どういうときが劣っていないって言…

信頼区間から標準誤差を推定する方法

メタアナリシスをしたい場合、 統合する点推定値と標準誤差が必要になる。 曝露有り無しと疾患ありなしが 生データとして入手できる場合は問題ないが、 多変量調整のあとの点推定値と95%信頼区間しかない場合は多い。 点推定値+95%信頼区間しか手に入らない…

標準正規分布のパーセンタイルとクォンタイル―上位何パーセント?に答える

平均70点、標準偏差15点のテストの場合、90点以上の学生は上位何パーセントに当たるか? という問題に使うパーセンタイル percentile とクォンタイル quantile。 それぞれ百分位数と分位数ともいわれる。 パーセンタイルとクォンタイルの統計ソフトRでの計算…

統計ソフトRで対応分析はどうやる?

対応分析(コレスポンデンス分析)とは、人の属性の類似性(もしくは対応)を図に表す分析。 結果を見るといろいろと解釈したくなる、面白い分析。 統計ソフトRでは、caというパッケージで分析可能。

統計ソフトRで母比率の区間推定はどうすればいいか?

母集団における割合のことを母比率と言う。割合は比率ともいう。 母比率の区間推定はどうやったらいいか?二つの方法を紹介する。